Nuestro personaje del Mes

Para este mes de Octubre de 2009, propongo tomar como "nuestro personaje del mes" a Joseph Felsenstein, cuyo nombre suena fuerte junto con quienes han contribuido en el estudio y análisis filogenéticos, así como la producción de software para análisis filogenético.



A continuación les pongo una pequeña biografía tomada de Wikipedia (y no es chafear) sobre su vida y estudios.

Tomado de Wikipedia: Joseph Felsenstein

Joseph "Joe" Felsenstein is Professor in the Departments of Genome Sciences and Biology and Adjunct Professor in the Departments of Computer Science and Statistics at the University of Washington in Seattle. He is best known for his work on phylogenetic inference, and is the author of Inferring Phylogenies, and principal author and distributor of the package of phylogenetic inference programs called PHYLIP. Closely related to his work on phylogenetic inference is his introduction of methods for making statistically independent comparisons using phylogenies (Felsenstein, 1985).

Felsenstein did his undergraduate work at the University of Wisconsin–Madison where he did undergraduate research under James F. Crow[1]. He then did doctoral work under Richard Lewontin in the 1960s, when he was at the University of Chicago[2], and did a postdoc at the Institute of Animal Genetics in Edinburgh[2] prior to becoming faculty at the University of Washington.

In addition to his work in phylogenetics, he is also noted for his work in theoretical population genetics, including studies on selection, migration, linkage, speciation, and the coalescent.

Honors include membership in the United States National Academy of Sciences and receiving the Darwin-Wallace Medal in 2008 (given every 50 years by the Linnean Society of London).

Y por si fuera poco les dejo un pequeño historial de publicaciones hechas por Joe, que sin lugar a dudas son tan complicadas como interesantes.

Fuente de las publicaciones: Workshop on Molecular Evolution

Felsenstein, J. 1973. Maximum-likelihood and minimum-steps methods for estimating evolutionary trees from data on discrete characters. Systematic Zoology, 22:240-249.

Felsenstein, J. 1978. Cases in which Parsimony of Compatibility Methods Will be Positively Misleading. Systematic Zoology, 27:401-410.

Felsenstein, J. 1981. Evolutionary trees from DNA sequences: a maximum likelihood approach. J. Mol. Evol., 17:368-376.

Felsenstein, J. 1983a. Inferring evolutionary trees from DNA sequences. pp 133-150 in Statistical Analysis of DNA Sequence Data, Weir, B. S. and Dekker, M. (eds.). New York.

Felsenstein, J. 1983b. Methods for inferring phylogenies: a statistical view. pp 315 in Numerical Taxonomy, Felsenstein, J. (ed.). Berlin.

Felsenstein, J. 1983c. Parsimony in systematics: biological and statistical issues. Ann. Rev. Ecol. Syst. 14:313-333.

Felsenstein, J. 1984. Distance methods for inferring phylogenies: a justification. Evolution 38:16-24.

Felsenstein, J. 1985a. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution 39:783-791.

Felsenstein, J. 1985b. Confidence limits on phylogenies with a molecular clock. Syst. Zool. 34:152-161.

Felsenstein, J. 1988a. Phylogenies and quantitative characters. Ann. Rev. Ecol. Syst. 19:445-471.

Felsenstein, J. 1988b. Phylogenies from molecular sequences: inference and reliability. Ann. Rev. Gen. 22:521-565.

Felsenstein, J. 2004. Inferring Phylogenies. Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts.

Felsenstein, J. and H. Kishino. 1993. Is there something wrong with the bootstrap on phylogenies? A reply to Hillis and Bull. Syst. Biol. 42:193-200.

Felsenstein, J. and G. A. Churchill. 1996. A Hidden Markov Model approach to variation among sites in rate of evolution. Mol. Biol. Evol. 13:93-104.

Felsenstein, J., M. K. Kuhner, J. Yamato, and P. Beerli. 1999. Likelihoods on coalescents: a Monte Carlo sampling approach to inferring parameters from population samples of molecular data. In "Statistics in Genetics and Molecular Biology", ed. F. Seillier. IMS Lecture Notes-Monograph Series, volume 33. LAMARC.

Les dejo por último una liga hacia la página web que contiene 385 programas para llevar a cabo análisis filogenéticos, así como 52 servidores disponibles hechos por Felsenstein.

Así o más prolífico este personaje.

Saludillos!

Algunos tips para mejorar...

Bueno a petición de algunos de mis compañeros bloggeros les dejo este post mini-tutorial html para hacer algunas cosillas interesantes a la hora de redactar un post, insertar imágenes, cambiar color, estilo y tamaño de letra, entre otras cosas.

He de comentar que este es un tutorial a partir de los comandos que usualmente yo uso, si existe alguna manera distinta de hacer las cosas, o bien, mejor o más rápida, entonces son más que bienvenidas en sus comentarios.

Primeramente les menciono que los comando en html siguen una regla muy simple: siempre hay un inicio y un final, es decir, hay un comando para iniciar el formato y cuando el texto que se está modificando termina, entonces se abre un comando de término del mismo. Para ello utilizaremos los signos "<" y ">", y dentro de ellos escribiremos el susodicho comando. Para efectos de poder ver la línea de comandos, sustituiremos los signos <> por los brackets [], respectivamente. Regularmente los comando de inicio van dentro de <>, y al final se escribe el mismo comando pero acompañado de un signo /, o sea: [comando]letras, texto[/comando]. No es necesario hacer espacios entre <> de las letras o demás comandos que estén fuera de ellos, no afecta esto al comando pues lo importante es lo que está dentro de los signos <>.

Cambiar fuente, color, tamaño y atributos de letra usando html.
Primero que nada, si desean, cuando escriben un post, cambiar la fuente pueden hacerlo utilizando el comando [font face="tipo de fuente"], luego escriben el texto que deseen que tenga esta característica y luego cierran el comando escribiendo [/font]. Recuerden cambiar los brackets por signos de <>.
Nota: si su ordenador no tiene instalado el tipo de letra que seleccionan, entonces no lo podrán ver en su post, por ello hagan una prueba o busquen la fuente instalada en su PC antes de seleccionarla.

Para cambiar tamaño de letra usan el comando [font size="tamaño de letra en número"] y terminan el comando usando [/font].

Para cambiar el color de texto usaremos el comando: [font color="código de color"] y cerramos el comando usando [/font]. Pueden buscar los códigos de colores en alguna pagina de html, o bien consultar esta que es mi favorita para estas cosas: Computerhope.com.

Para agregarle atributos como cursiva o negrita que son los más comunes, usaremos los comandos [i] y [b], respectivamente. No olviden terminar el comando usando [/i] y [/b], respectivamente.

Existen diferentes tipos de edición de texto, pero creo, en general, que estos son los más comunes.

Insertar links sobre textos
Para esto usaremos un comando un poco más largo pero sencillo. Primero lo que debemos tener en cuenta son dos cosas: ¿Cuál es el sitio web al cual queremos accesar? y ¿Qué nombre queremos usar para que sirva como link?.

Una vez seleccionadas estas dos cosas, usamos el siguiente comando:
[a href="dirección del sitio al que queremos ir"]Texto que servirá de link[/a].
Y listo, con eso tendrán una liga a un sitio web usando una línea de texto, como podría ser el nombre de la página o bien una palabra clave. Ejemplo usando la línea de comandos anterior: visita el blog de Grado Reactivo

Ahora si queremos que a la hora de click en el link nos abra una pestaña nueva del navegador en vez de ir al sitio desde la misma pestaña, simplemente agregamos despues de [a href="website" el comando target="_blank" y cerramos la línea de comandos, entonces quedaría algo así:
[a href="website" target="_blank"]link[/a]

Ahora hagamos la prueba usando este código para ir al sitio de Grado Reactivo. Y dando click en el siguiente link dará como resultado visitar dicho blog pero en una pestaña diferente:

GRADO REACTIVO

Nota: esta función también aplica cuando haces imágenes que sirven como ligas a sitios web.

Hacer links a sitios web usando imágenes
Para esto utilizaremos el siguiente comando:
[p align="left"][a href="El sitio web que queremos poner como liga"][img alt="titulo alterno de la imagen" src="dirección donde esta la imagen albergada" title="lo que quieres que aparezca cuando posiciones el mouse sobre la imagen sin dar click"/][/a][/p]
Si tienen dudas sobre esto, pueden consultar el post que hice hace algunos días titulado como poner imagenes con liga hacia otro sitio

Insertar imágenes en posts
Este es un comando fácil, sólo hay que especificar la dirección de correo donde está la imagen, y podemos cambiar el tamaño de la misma. Para ello utilizaremos el comando siguiente:
[img src="dirección web donde está la imagen albergada" width="número" height="número"]
Entonces, y con esto termino, no olviden cambiar los bracktes [] por signos <>. Espero les sea de utilidad este pequeño manualito de html. En lo personal, pensé que era muy complejo, pero una vez que te aprendes los comandos básicos lo demás llega más fácil. Bueno, si tienen algunas preguntas extras o más comando que quisieran aprender, pueden revisar estas páginas:
--> Tizag.com
--> w3schools.com

Saludillos!!

Un poco de cultura o.O y comicidad ociosa

Bueno, como algo cómico les dejo ahora un video (youtube kindly provided) sobre el origen, uso y ejemplos de la palabra FUCK en inglés, que la verdad son muy divertidos...


Espero nadie se ofenda, es humor del bueno; fuerte, pero aún bueno.

Saludillos!!